首页>英国生物信息学理论与实践Bioinformatics Theory and Practice
生物信息学理论与实践
CSC8313
Bioinformatics Theory and Practice
学习目标
课程内容:
本课程旨在让学生了解生物信息学分析背后的基本理论、现代生物信息学的计算和算法方法,以及实际应用这些理论的经验。课程介绍了分子生物学、序列分析和基因组时代生物学的基本概念。同时,介绍了许多不同的工具及其用法,以及其中一些工具背后的分析算法,包括 BLAST 和动态编程。此外,还介绍了生物序列分析、组装、比较和注释的高级方法,包括比较基因组学。除此之外,课程还介绍了蛋白质主题、结构和家族以及系统发生学的基础知识。课程的后半部分将介绍现代后基因组生物信息学背后的概念,包括生物通路和网络材料。
课程目标:
1、介绍分子生物学研究中产生的数据。
2、强化序列分析和后基因组生物信息学概念和技术的基础理论。
3、了解生物信息学分析的分布式可用资源。
课程大纲:
1、分子生物学的基本概念:基因组、转录组、蛋白质组。
2、数据库搜索工具。
3、测序算法。
4、序列分析:基因组组装和注释、序列比对和比较、多序列比对。
5、系统发育分析、基因组比较和分子进化。
6、蛋白质家族。
7、蛋白质结构预测。
8、生物网络分析,包括基因网络和通路分析。
9、转录组学和蛋白质组学分析,包括单细胞数据分析。
10、其他组学数据分析。
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